Действие разворачивается спустя несколько лет после событий "The Fruit of Grisaia". Бывшая академия Михама, ранее служившая убежищем для девушек, была переоборудована в учебное заведение организации SORD (Special Organization for Research & Development). Эта структура занимается подготовкой кадров для нужд национальной обороны. Персонал академии состоит из нескольких специалисток с разными навыками. Рена и Маки работают с огнестрельным оружием. Тоха и Гуми являются снайперами.

Старшеклассник Тэруаки Накамура переезжает на Окинаву и сталкивается с трудностью: он не понимает местный диалект. Попытки самостоятельно освоить особенности речи не приносят заметных результатов. Ситуация усложняется тем, что Тэруаки влюбляется в одноклассницу Хину Кян, чей говор особенно сложен для восприятия. Из-за языкового барьера общение между ними практически отсутствует, что вызывает у Тэруаки разочарование. Лучшая подруга Хины, Кана Хига, предлагает помощь и становится переводчиком для

Такуми Ирума становится жертвой случайного заклинания призыва героев в другой мир. После смерти он встречает богиню Норн, которая объясняет, что возвращение на Землю невозможно. В качестве компенсации за причиненные неудобства Ирума просит наделить его профессией алхимика, считая ее безобидной. Богиня выполняет просьбу, но добавляет дополнительные навыки и благословение. Полученный дар не позволяет Ируме полностью избежать участия в спасении мира. Однако богиня отправляет его в прошлое - за год

Тридцатилетний мужчина, мечтавший стать волшебником, погибает и перерождается в другом мире. Он появляется на свет в облике ребёнка по имени Шион и растёт рядом со своей старшей сестрой Мари, которая заботится о нём. Шион с нетерпением ждёт возможности использовать магические силы, но вскоре выясняет, что в этом мире магия, по-видимому, отсутствует. Он проводит последующие годы в подавленном состоянии, пока некое мистическое явление у озера не привлекает внимание брата и сестры, возрождая в

Группа детей, отобранных для обучения в специальном классе усиления "Элементы" в академии, расположенной на острове Эносима, получает задание пилотировать истребители "Векторная машина". Эти машины работают на энергии эмоций. Детей принуждают сражаться против таинственных вторгающихся существ, называемых "Мифическими зверями". В ходе битвы, следуя указаниям из видения, один из пилотов, Сакко, активирует комбинацию под названием "Планетарный синтез", в

Старшеклассницу Акиру Масаки во время возвращения домой переносит в другой мир, где существует магия. Людей, способных её использовать, называют волшебниками. Некоторые из них ежегодно избираются для борьбы с Великим Бедствием. Раньше с катастрофой удавалось справляться, но со временем она стала настолько сильной, что унесла жизни многих волшебников. В этом мире существует Великий Мудрец — персона, обладающая способностью направлять избранных волшебников в битве против Великого Бедствия. Эта

Королевство Науки готовится к противостоянию с сущностью, вызвавшей феномен окаменения. Предполагается, что она находится на Луне. Для создания космического корабля требуются значительные ресурсы, разбросанные по разным регионам мира, а также большое количество участников. Сенку и его союзники отправляются на судне «Персей» в экспедицию через океан для сбора необходимых материалов. По прибытии в Америку выясняется, что местные технологии не только сохранились, но и превзошли достижения