Аркадия моей юности: Бесконечный путь SSX

События разворачиваются после поражения в войне против империи Иллюмидус. Эта инопланетная цивилизация занимается порабощением и уничтожением обитаемых планет. Земля перешла под контроль захватчиков. Харлок и его соратники объявлены врагами человечества и изгнаны с планеты. Империя продолжает преследование.

Харлок, Тотиро и Эмеральда получают кодовые номера S-00999, S-00998 и X-00001 соответственно. Они объявлены в розыск. Теперь им приходится противостоять не только силам Иллюмидуса, но и многочисленным охотникам за головами. Люди, желающие получить вознаграждение, становятся дополнительной угрозой для беглецов.

Несмотря на сложную ситуацию, бывшие защитники Земли продолжают свой путь. Им предстоит сражаться на два фронта - против могущественной империи и против тех, кто видит в них лишь источник наживы. Выживание и продолжение борьбы становятся главными задачами для преследуемой группы.