Индекс волшебства: Чудо Эндимиона

После завершения строительства космического подъемника «Эндимион» в Академия-Сити главный герой Тома Камидзё и его подруга Индекс случайно встречают эспера нулевого уровня по имени Ариса Мэйго. Их знакомство происходит в обычной обстановке, без особых предзнаменований.

«Ассоциация магов» начинает преследовать Арису по невыясненным причинам. Организация предпринимает нападение на Академия-Сити, что вынуждает местных жителей объединиться. Шатаура Секвенция возглавляет движение сопротивления, сформированное для защиты города от магической угрозы. Силы науки и магии вступают в прямое противостояние.

Позднее Стэйл Магнус раскрывает главным героям информацию о том, что Ариса может быть использована как инструмент для разжигания полномасштабного конфликта между миром Магии и миром Науки. Героям предстоит выяснить истинные намерения обеих сторон и предотвратить возможную войну.