Летопись войн в школе Мурё

Семнадцатилетний Шиничи Кудо обладает аналитическими способностями, за которые его сравнивают с Шерлоком Холмсом. После посещения парка аттракционов с подругой детства Ран Мори он становится свидетелем подозрительной сделки между членами преступной организации в темном переулке. Заметив наблюдателя, один из участников оглушает Шиничи и вводит ему экспериментальный препарат. Потеряв сознание, подросток не успевает понять природу вещества.

Очнувшись, Шиничи обнаруживает, что его тело уменьшилось до размеров семилетнего ребенка. Препарат изменил физиологические параметры, но не затронул память и интеллектуальные способности. Понимая, что организация будет искать его, чтобы устранить свидетеля, он принимает решение скрыть свою личность. Под видом дальнего родственника Шиничи поселяется в доме Ран, чей отец Когоро Мори работает частным детективом.

Сменив имя на Конан Эдогава, Шиничи использует свое новое положение, чтобы продолжать расследование. Он незаметно помогает Когоро раскрывать дела, используя скрытые микрофоны и подсказки. Параллельно Конан собирает информацию о преступной организации, члены которой носят кодовые имена в честь алкогольных напитков. Главной целью становится поиск противоядия и возвращение к прежнему облику.