Атри: Мои дорогие моменты

Действие происходит в недалеком будущем, где большая часть суши скрыта под водой из-за повышения уровня мирового океана. Главный герой - Нацуки Икаруга, молодой человек, потерявший мать и ногу в результате трагического происшествия несколько лет назад. В его распоряжении остались старый корабль и батискаф, а также значительные долги, перешедшие по наследству от бабушки - профессора морской геологии Нонко Ятигусы.

С целью погасить задолженность Нацуки решает отправиться на поиски затонувшего здания, где прежде работала его бабушка. Согласно слухам, она хранила в этом месте драгоценности. Однако вместо ожидаемых ценностей герой обнаруживает капсулу, внутри которой находится спящий робот-гуманоид по имени Атри.

После пробуждения Атри сообщает, что намерена помогать Нацуки, по крайней мере до тех пор, пока не восстановит в памяти последнее поручение, полученное от своей прежней хозяйки. Это событие становится отправной точкой для дальнейших событий, в ходе которых персонажам предстоит взаимодействовать и решать возникающие проблемы.